• 14 de Marzo de 2008, la Universidad Salvadoreña Alberto Masferrer otorgó Doctorado Honoris Causa en Desarrollo Humano al Padre Flavián Mucci por su entrega y sacrificio por el prójimo en El Salvador.

• 6 de Marzo de 2008, el Padre Flavián Mucci recibe en nombre de la Asociación Agape de El Salvador distinción honorífica por parte de la Asamblea Legislativa como "Distinguida Asociación Humanitaria" por su trabajo altruista a favor de la población salvadoreña.

• 29 de Febrero de 2008, el Consejo de Educación Superior entrega diploma al Padre Flavián Mucci como un reconocimiento especial por su contribución en el campo de la educación.

• 30 de Enero de 2008, recibe el máximo galardón entregado por la Cámara de Comercio e Industria de El Salvador: "Palma de Oro", por contribuir a mejorar la calidad de vida de millares de salvadoreños a lo largo de su brillante y ejemplar trayectoria de responsabilidad social empresarial, impulsando así de el desarrollo humano y económico de El Salvador.

• El 28 de Enero 2008 recibe galardón "Quijote Mayor 2008" por parte de la Alcaldía Municipal de Sonsonate por la fructífera labor de AGAPE en sus 30 años de trayectoria.

• El 16 de Agosto de 2007 recibe condecoración al Merito Docente y Cultural "Gabriela Mistral", por su extensa e importante labor educacional realizada en beneficio de los niños más desprotegidos de El Salvador. Otorgado por la Embajada de Chile.

• Doctorado Honoris Causa en Desarrollo Social y Obras Humanitarias" Por su compromiso por cambiar la forma de vida de distintas comunidades del país. Otorgado por la Universidad Pedagógica el 9 de Marzo de 2007

• "Certificación ISO 9001:2000", La Asociación Agape de El Salvador fundada por el Padre Flavián Mucci, recibió el certificado ISO 9001:2000 que nos acredita como una Asociación de clase mundial, certificada en los Procesos Enseñanza Aprendizaje y Proceso Administrativo Financiero, el 21 de Diciembre de 2006

• Honor al Mérito por su destacada labor profesional y social efectuando acciones en beneficio de la niñez, juventud y adultos. Otorgado por el Colegio Humanista de El Salvador el 20 de Octubre de 2006

• XXV Exposición Técnica Cultural denominada "Fray Flavián Mucci", por sus obras valiosas hacia el pueblo salvadoreño. Esta denominación fue otorgada por el Instituto Técnico EXSAL, realizada del 16 al 22 de Octubre de 2006.

• "Galardón al Orgullo Salvadoreño", por su destacada labor en su entrega y dedicación al pueblo salvadoreño. Otorgado por el Club Rotario Maquilishuat, el 25 de mayo de 2006.

• Premio Presea "Salvadoreño Ejemplar de FUSATE", por su aporte, dinamismo, ejemplo de actividad y productividad de la persona. Otorgado por Fundación Salvadoreña de la Tercera Edad (FUSATE) el 3 de Febrero de 2005.

• "Premio Activo de Oro", por su reconocida labor a favor de la niñez salvadoreña, otorgado por el Club Activo 20-30 el 14 de septiembre de 2004.

• El día 15 de marzo 2004 CC International Centro América - Latin America Group de México, D.F entrega RECONOCIMIENTO A LA EXCELENCIA a Asociación AGAPE de El Salvador por contar con mucho prestigio, por su labor altruista y el fomento de la formación de valores morales y espirituales, en beneficio de la población salvadoreña.

• En octubre 2003 el Padre Flavian fue nombrado "ANGEL GABRIEL" por su importante e invaluable labor social y humanitaria en El Salvador. Por los Ángeles Voluntarios de la Universidad José Matías Delgado de El Salvador

• En Abril 2003 la Asamblea Legislativa de El Salvador, entregó reconocimiento a AGAPE de El Salvador en su 25th aniversario y por la importante labor a través de sus programas de ayuda en El Salvador

• Marzo 2003 El Nuncio Apostólico Mons. Giacinto Berlocco entrego en nombre de su Santidad Juan Pablo II la medalla dorada BENEMERENTI al Padre Flavian Mucci como reconocimiento en el 25º. Aniversario de Asociación AGAPE de El Salvador

• En enero de 2003 El padre Flavian fue condecorado por el Gobierno de El Salvador en honor a la labor y compromiso que la Asociación AGAPE de El Salvador realiza para contribuir a la reconstrucción de El Salvador y ayudar a mejorar la condición de vida de los salvadoreños.

• El día 03 de octubre de 2002 el Padre Flavian fue condecorado por el Club Rotario de San Salvador, como SOCIO HONORARIO en reconocimiento a su labor humanitaria

• El día 15 de diciembre de 2001, Recibe la investidura Académica como "DOCTOR HONORIS CAUSA EN HUMANIDADES", otorgado por la Universidad de Sonsonate.

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